Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vmn1r167G3UW71 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r167G3UW71 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms