Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Colca2F8VPY8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms