Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms