Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms