Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms