Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Prrt4B2RU40 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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