Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CK137956B1AYM9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms