Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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