Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Top3bQ9Z321 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Top3bQ9Z321 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Top3bQ9Z321 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms