Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac6Q9Z2V5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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