Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms