Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Vax2Q9WTP9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vax2Q9WTP9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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