Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col4a3Q9QZS0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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