Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcl11aQ9QYE3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcl11aQ9QYE3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms