Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ap3b2Q9JME5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms