Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms