Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Col5a3Q9JLI2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Col5a3Q9JLI2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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Col5a3Q9JLI2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms