Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
SacsQ9JLC8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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