Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Nectin3Q9JLB9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Nectin3Q9JLB9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Nectin3Q9JLB9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Nectin3Q9JLB9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Nectin3Q9JLB9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Nectin3Q9JLB9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Nectin3Q9JLB9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nectin3Q9JLB9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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