Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gde1Q9JL56 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gde1Q9JL56 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gde1Q9JL56 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gde1Q9JL56 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gde1Q9JL56 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gde1Q9JL56 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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