Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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