Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms