Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xab2Q9DCD2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms