Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ap1s2Q9DB50 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ap1s2Q9DB50 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms