Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Med27Q9DB40 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Med27Q9DB40 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Med27Q9DB40 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Med27Q9DB40 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Med27Q9DB40 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Med27Q9DB40 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Med27Q9DB40 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Med27Q9DB40 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Med27Q9DB40 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med27Q9DB40 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
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