Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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