Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tvp23bQ9D8T4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms