Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Tmem54Q9D7S1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Tmem54Q9D7S1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Tmem54Q9D7S1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Tmem54Q9D7S1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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