Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc6Q9D4E6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc6Q9D4E6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc6Q9D4E6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc6Q9D4E6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc6Q9D4E6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc6Q9D4E6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc6Q9D4E6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc6Q9D4E6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pabpc6Q9D4E6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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