Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Syce1Q9D495 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Syce1Q9D495 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce1Q9D495 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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