Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Snx29Q9D3S3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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