Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms