Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PmpcbQ9CXT8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms