Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nip7Q9CXK8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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