Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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