Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MINDY3Q9CV28 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms