Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms