Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms