Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms