Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms