Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ssxb1Q9CPU1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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