Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms