Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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NsmfQ99NF2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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