Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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PtprtQ99M80 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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PtprtQ99M80 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PtprtQ99M80 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PtprtQ99M80 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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PtprtQ99M80 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprtQ99M80 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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