Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms