Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nus1Q99LJ8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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