Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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