Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Smim11aQ99J19 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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