Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Kif1b-202ENSMUST00000055647 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SptssbQ925E8 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms