Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atl3Q91YH5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms